Comissões internas
Comissão de bolsas
De acordo com a Portaria CAPES nº 52, de 26 de maio de 2000, cada programa de pós-graduação deve instituir uma Comissão de Bolsas, composta de no mínimo três membros: o Coordenador do programa (Presidente da Comissão), um representante do quadro permanente do programa e um do corpo discente. A Comissão de Bolsas cuida da definição de critérios de distribuição, manutenção e redistribuição das bolsas alocadas diretamente ao Programa.
Comissão do Processo Seletivo do programa
A Comissão do Processo Seletivo do programa é composta pelos docentes do PPGAU, sendo designada pelo Colegiado Acadêmico do Mestrado. Esta Comissão é formada anualmente e atua em todas as etapas do processo de seleção. Tem autonomia para resolver os problemas de correção e atribuição das notas nas fases do processo de seleção do Edital, assim como os eventuais recursos interpostos.
Comissão de Avaliação Docente do programa
Esta comissão é formada por dois docentes do PPGAU e um docente externo e tem como objetivo avaliar anualmente a produção científica do programa.